El análisis longitudinal de datos de polimorfismos en los genes κ-caseína y β-lactoglobulina revela efectos diferenciales a lo largo de la trayectoria de la curva de lactancia en cabras lecheras tropicales
| dc.contributor.author | Calvo-Cardona, Samir Julián | |
| dc.contributor.author | Corrales-Álvarez, Juan David | |
| dc.contributor.author | Cardona-Cadavid, Henry | |
| dc.contributor.author | Munilla, Sebastián | |
| dc.contributor.author | Cantet, Rodolfo | |
| dc.contributor.author | Rogberg-Muñoz, Andrés | |
| dc.date.accessioned | 2026-02-18T15:58:06Z | |
| dc.date.available | 2026-02-18T15:58:06Z | |
| dc.date.issued | 2016 | |
| dc.description.abstract | Los genes de la κ-caseína (CSN-3) y la β-lactoglobulina (BLG) son ampliamente polimórficos en los rumiantes. Diversos estudios de asociación han estimado los efectos de los polimorfismos en estos genes sobre la producción de leche, su composición y las propiedades para la elaboración de queso. Por lo general, estos resultados se basan en la producción integrada a lo largo de la curva de lactancia o en estudios transversales realizados en días específicos en leche (DIM). Sin embargo, dado que la expresión diferencial de los genes de proteínas lácteas ocurre a lo largo de la lactancia, el efecto de los polimorfismos puede variar con el tiempo. En este estudio, ajustamos un modelo de regresión de efectos mixtos a registros diarios de producción (test-day) de rendimiento lechero y de características de calidad de la leche (rendimientos de grasa, proteína y sólidos totales) en cabras lecheras tropicales colombianas. Utilizamos los polimorfismos A/B bien caracterizados en los genes CSN-3 y BLG. Argumentamos que este enfoque proporciona estimadores más eficientes que los diseños transversales, dado el mismo número y patrón de observaciones, y permite excluir la variación entre individuos del error del modelo. El genotipo AA de BLG mostró un desempeño superior al del genotipo BB para todos los caracteres a lo largo de toda la curva de lactancia, mientras que el heterocigoto presentó un desempeño intermedio. No se observó un patrón constante similar para el gen CSN-3 entre el homocigoto AA y el heterocigoto (el genotipo BB estuvo ausente en la muestra). Las diferencias entre los efectos genotípicos de los polimorfismos BLG y CSN-3 fueron estadísticamente significativas durante el pico y la mitad de la lactancia (aproximadamente 40–160 DIM) para el gen BLG, y solo durante la mitad de la lactancia (80–145 DIM) para el gen CSN-3. Asimismo, estimamos los efectos aditivos y dominantes del locus BLG. Este locus mostró un comportamiento aditivo estadísticamente significativo a lo largo de toda la trayectoria de lactancia para todos los caracteres de calidad, mientras que para la producción de leche el efecto no fue significativo en las etapas finales. A su vez, se detectó un efecto de dominancia estadísticamente significativo únicamente para el rendimiento de grasa en las etapas temprana y de pico de la lactancia (aproximadamente 1–45 DIM). El análisis longitudinal de los registros diarios permitió estimar los efectos diferenciales de los polimorfismos a lo largo de la curva de lactancia, señalando las etapas que podrían verse afectadas por el gen. | |
| dc.description.abstracteng | The κ-casein (CSN-3) and β-lactoglobulin (BLG) genes are extensively polymorphic in ruminants. Several association studies have estimated the effects of polymorphisms in these genes on milk yield, milk composition, and cheese-manufacturing properties. Usually, these results are based on production integrated over the lactation curve or on cross-sectional studies at specific days in milk (DIM). However, as differential expression of milk protein genes occurs over lactation, the effect of the polymorphisms may change over time. In this study, we fitted a mixed-effects regression model to test-day records of milk yield and milk quality traits (fat, protein, and total solids yields) from Colombian tropical dairy goats. We used the well-characterized A/B polymorphisms in the CSN-3 and BLG genes. We argued that this approach provided more efficient estimators than cross-sectional designs, given the same number and pattern of observations, and allowed exclusion of between-subject variation from model error. The BLG genotype AA showed a greater performance than the BB genotype for all traits along the whole lactation curve, whereas the heterozygote showed an intermediate performance. We observed no such constant pattern for the CSN-3 gene between the AA homozygote and the heterozygote (the BB genotype was absent from the sample). The differences among the genotypic effects of the BLG and the CSN-3 polymorphisms were statistically significant during peak and mid lactation (around 40-160 DIM) for the BLG gene and only for mid lactation (80-145 DIM) for the CSN-3 gene. We also estimated the additive and dominant effects of the BLG locus. The locus showed a statistically significant additive behavior along the whole lactation trajectory for all quality traits, whereas for milk yield the effect was not significant at later stages. In turn, we detected a statistically significant dominance effect only for fat yield in the early and peak stages of lactation (at about 1-45 DIM). The longitudinal analysis of test-day records allowed us to estimate the differential effects of polymorphisms along the lactation curve, pointing toward stages that could be affected by the gene. | |
| dc.format.extent | 7299-7307 | |
| dc.format.mimetype | application/pdf | |
| dc.identifier.citation | Calvo Cardona, S. J., Corrales Alvarez, J. D., & Cardona Cadavid, H. (2016). Longitudinal data analysis of polymorphisms in the k-casein and B-lactoglobulin genes in tropical dairy goats. Journal of Dairy Science, 99(9), 7299-7307. https://doi.org/10.3168/jds.2016-10954 | |
| dc.identifier.doi | https://doi.org/10.3168/jds.2016-10954 | |
| dc.identifier.issn | 1525-3198 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.12516/2691 | |
| dc.language.iso | en | |
| dc.publisher | American Dairy Science Association | |
| dc.publisher.faculty | Facultad de Ciencias Agropecuarias | |
| dc.publisher.group | GIAZ | |
| dc.relation.ispartofjournal | Journal of Dairy Science | |
| dc.rights.accessrights | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |
| dc.rights.creativecommons | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ | |
| dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ | |
| dc.rigths.coar | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |
| dc.subject | Aditivos | spa |
| dc.subject | cabras lecheras | spa |
| dc.subject | datos longitudinales | spa |
| dc.subject | β-lactoglobulin | spa |
| dc.subject | κ-casein | spa |
| dc.subject.proposal | additive | en |
| dc.subject.proposal | dairy goats | en |
| dc.subject.proposal | dominance | en |
| dc.subject.proposal | longitudinal data | en |
| dc.subject.proposal | β-lactoglobulin | en |
| dc.subject.proposal | κ-casein. | en |
| dc.title | El análisis longitudinal de datos de polimorfismos en los genes κ-caseína y β-lactoglobulina revela efectos diferenciales a lo largo de la trayectoria de la curva de lactancia en cabras lecheras tropicales | spa |
| dc.title.alternative | Longitudinal data analysis of polymorphisms in the κ-casein and β-lactoglobulin genes reveals differential effects along the trajectory of the lactation curve in tropical dairy goats | |
| dc.type.coar | http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1 | |
| dc.type.coar | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |
| dc.type.coarversion | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |
| dc.type.driver | info:eu-repo/semantics/article | |
| dc.type.local | Artículo de revista | |
| dc.type.redcol | http://purl.org/redcol/resource_type/CJournalArticle |