Browsing by Author "Corrales-Álvarez, Juan David"
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Item El análisis longitudinal de datos de polimorfismos en los genes κ-caseína y β-lactoglobulina revela efectos diferenciales a lo largo de la trayectoria de la curva de lactancia en cabras lecheras tropicales(American Dairy Science Association, 2016) Calvo-Cardona, Samir Julián; Corrales-Álvarez, Juan David; Cardona-Cadavid, Henry; Munilla, Sebastián; Cantet, Rodolfo; Rogberg-Muñoz, AndrésLos genes de la κ-caseína (CSN-3) y la β-lactoglobulina (BLG) son ampliamente polimórficos en los rumiantes. Diversos estudios de asociación han estimado los efectos de los polimorfismos en estos genes sobre la producción de leche, su composición y las propiedades para la elaboración de queso. Por lo general, estos resultados se basan en la producción integrada a lo largo de la curva de lactancia o en estudios transversales realizados en días específicos en leche (DIM). Sin embargo, dado que la expresión diferencial de los genes de proteínas lácteas ocurre a lo largo de la lactancia, el efecto de los polimorfismos puede variar con el tiempo. En este estudio, ajustamos un modelo de regresión de efectos mixtos a registros diarios de producción (test-day) de rendimiento lechero y de características de calidad de la leche (rendimientos de grasa, proteína y sólidos totales) en cabras lecheras tropicales colombianas. Utilizamos los polimorfismos A/B bien caracterizados en los genes CSN-3 y BLG. Argumentamos que este enfoque proporciona estimadores más eficientes que los diseños transversales, dado el mismo número y patrón de observaciones, y permite excluir la variación entre individuos del error del modelo. El genotipo AA de BLG mostró un desempeño superior al del genotipo BB para todos los caracteres a lo largo de toda la curva de lactancia, mientras que el heterocigoto presentó un desempeño intermedio. No se observó un patrón constante similar para el gen CSN-3 entre el homocigoto AA y el heterocigoto (el genotipo BB estuvo ausente en la muestra). Las diferencias entre los efectos genotípicos de los polimorfismos BLG y CSN-3 fueron estadísticamente significativas durante el pico y la mitad de la lactancia (aproximadamente 40–160 DIM) para el gen BLG, y solo durante la mitad de la lactancia (80–145 DIM) para el gen CSN-3. Asimismo, estimamos los efectos aditivos y dominantes del locus BLG. Este locus mostró un comportamiento aditivo estadísticamente significativo a lo largo de toda la trayectoria de lactancia para todos los caracteres de calidad, mientras que para la producción de leche el efecto no fue significativo en las etapas finales. A su vez, se detectó un efecto de dominancia estadísticamente significativo únicamente para el rendimiento de grasa en las etapas temprana y de pico de la lactancia (aproximadamente 1–45 DIM). El análisis longitudinal de los registros diarios permitió estimar los efectos diferenciales de los polimorfismos a lo largo de la curva de lactancia, señalando las etapas que podrían verse afectadas por el gen.Item Efectos genéticos y ambientales sobre la curva de lactancia en cabras lecheras del trópico(Fundación para el Desarrollo de la Investigación Agraria, 2017) Calvo-Cardona, Samir Julian; Cardona-Cadavid, Henry; González-Herrera, Luis Gabriel; Corrales-Álvarez, Juan DavidEl objetivo de este trabajo fue estimar los parámetros de las curvas de lactancia en cabras, como tiempo al pico (TP), producción al pico (PP), persistencia (PER) y producción acumulada a los 210 días de lactancia (P210), así como determinar los efectos de época de parto, número de partos, tipo racial y manejo nutricional. Para estimar los parámetros de las curvas se analizaron 4160 controles lecheros, pertenecientes a 467 lactancias de cabras de diferentes apriscos del departamento de Antioquia-Colombia, que incluyeron individuos con registro completo de: fechas de parto, número de parto y tipo racial. Se utilizó el modelo Nelder para caracterizar la curva de lactancia y estimar los parámetros mencionados. Adicionalmente, fueron estimadas las correlaciones fenotípicas entre cada una de las características de la curva de lactancia. Los resultados mostraron un tiempo al pico de 23,9 días, alcanzando una producción en este punto de 2,11 kg. La persistencia promedio fue del 64,3 % y la producción acumulada a los 210 días en leche de 285 kg. Se encontró efecto significativo del tipo racial sobre P210 y del número de parto sobre PP y PER; así como efecto altamente significativo de la época de parto sobre P210 y TP. Los resultados sugieren que es posible estimar las funciones que caracterizan las curvas de lactancia de las cabras de Antioquia y los fenómenos genéticos y ambientales que las afectan.Item Evaluaciones genéticas en cabras lecheras con escasa información de pedigrí: diferentes enfoques para el uso de información molecular(Springer, 2024) Calvo-Cardona, Samir Julián; García-Baccino, Carolina Andrea; Escobar-Restrepo, Carlos Santiago; Cardona-Cadavid, Henry; Corrales-Álvarez, Juan David; Gualdron-Duarte, José Luis; Rogberg-Muñoz, AndrésUna de las limitaciones para implementar programas de mejoramiento animal en sistemas de producción a pequeña escala o extensivos es la falta de registros productivos y genealógicos. En este contexto, los marcadores moleculares pueden contribuir a obtener información útil para los programas de mejoramiento. Este estudio aborda la inclusión de datos moleculares en los modelos tradicionales de evaluación genética, como efecto aleatorio mediante la reconstrucción del pedigrí molecular y como efecto fijo mediante la agrupación bayesiana. Los métodos se evaluaron en características de la curva de lactancia en 14 hatos caprinos lecheros con información fenotípica y pedigrí incompletos. Los resultados mostraron un incremento del 37,3 % en las relaciones respecto a las originales utilizando MOLCOAN y una agrupación en cinco grupos genéticos. Los datos permitieron estimar la varianza aditiva, la varianza del error y la heredabilidad mediante cuatro modelos diferentes, que incluyen información de pedigrí y molecular. Los valores del Criterio de Información de la Deviance (DIC) evidencian un mejor ajuste de los modelos que incorporan información molecular, ya sea como efecto fijo (grupos genéticos) o como efecto aleatorio (matriz molecular). La información molecular proveniente de marcadores simples puede complementar las estrategias de mejoramiento genético en poblaciones con información limitada.